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公開日:2025.05.30
更新日:2026.02.04

医療法人化のメリット・デメリット徹底解説

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このような経営者様におすすめ

医療法人化をご検討されている院長先生

本格的に節税対策を検討したい院長先生

将来的に分院展開や介護事業など、事業拡大を考えたい院長先生

医療法人化について税理士からの提案が弱いと感じている院長先生

医療法人の基本から知りたい院長先生

目次

1、医療法人化とは何か?基本とメリット・デメリット

2、医療法人化を検討すべき最適なタイミング

3、医療法人設立に向けた具体的な手続きの流れ

4、クリニックに強い税理士に変更&医療法人化し、納税額を57%削減!資産形成の体制構築に成功した事例【個人クリニック / 耳鼻科 / 年商2.5億円】

5、クリニックに強い税理士なら受けられるサポート

レポートの内容

本レポートでは、「医療法人化」のメリット・デメリット、医療法人化を検討すべき最適なタイミングについて解説します。

医療法人設立に向けた手続きの流れや、医療法人化をきっかけに納税額を57%削減できた事例とは?

 

このレポートを読むメリット

①医療法人化するメリット&デメリットががわかる

 

②医療法人化の流れがわかる

 

③医療法人化をする際に、税理士に何をしてもらうべきかがわかる

ダウンロード特典

【ダウンロード特典:個別経営相談】

 

東京本社・大阪本社ではもちろん、オンライン会議でも行うことができるため、全国どこの場所からでも相談可能です。

無料経営相談をぜひお気軽にお申し込みください。

【2026年版】医療法人化で「失敗しない」ための実戦セミナー開催!

本コラムでは医療法人化のメリット・デメリットについて解説しましたが、実は「どの税理士をパートナーに選ぶか」で、法人化後の手残り額や経営の自由度は大きく変わります。

実際、税理士を変更したことで3,200万円の税額削減を実現し、理想的な医療法人化を叶えた事例もございます。

下記のセミナーでは、本コラムの内容を一歩深掘りし、失敗しない医療法人化の進め方や、成長を支援してくれる税理士の選び方を詳しく解説いたします。

■【医科】医療法人化のための税理士変更セミナー

医療法人化で後悔しないための「税理士選び」を学ぶ

本コラムで解説した通り、医療法人化には複雑なシミュレーションや行政手続きが伴います。

「結局、うちはいつ法人化すべき?」「今の税理士で大丈夫?」という疑問を解消し、実体験に基づいた「3,200万円の税額削減事例」を公開するセミナーを開催いたします。

<開催概要>
開催日程:2026年 3月3日(火)、4日(水)、5日(木)、6日(金) ※所要時間75分

参加費用:無料

開催形式:オンライン開催

 

お客様の声

税理士を変更したことで、財務体質の改善や
経理の効率化に成功した事例を紹介いたします。

院内処方の仕入れ額年300万円削減や支払方法の最適化など、様々なアドバイ…

  • 業種 病院・クリニック
  • エリア 関東
  • 年商 1.5億円
  • 従業員 11~20名
お問合せのきっかけ
当院は山梨県富士吉田市にありまして、父である先代が1975年に創業し、昨年無事に50周年を迎えた眼科診療所です。
15年前に私が院長として事業継承し、現在は手術等を行わない無床の外来中心の診療を行っております。ありがたいことに患者数も順調に増え、事業としても着実に成長してきている状況です。

しかし経営面において、先代から長年お付き合いのある税理士さんとの関係性に限界を感じていました。
当時の税理士事務所は連絡をしても担当窓口から税理士さんへ、そしてまたこちらへと伝言ゲームのような状態になっており、細かな確認や返答に非常に時間がかかってしまっておりました。

また一般的な税務のアドバイスはいただけたものの、「医療」という特殊な分野への深い理解や新しい制度変更に対する発展的な提案は、こちらからお伺いしない限り出てこないという状況に物足りなさを感じていました。
何より税理士が、年1回の確定申告に向けた単なる「記帳代行」のレベルにとどまっており、私自身がバックオフィス業務を抱え込んでしまっていたため、本来集中すべき診療の妨げになって、時期によっては心身の負担も大きく、経営者としての強い孤独感や悩みを抱えていました。
そんな折、船井総研さんからご提案をいただき、現状の課題を解決して医院を発展させるため、思い切って医療経営に強い新たな税理士への変更を決断しました。
導入効果
税理士変更直後に過去の確定申告データを詳細に確認したところ、以前の税理士の「賃上げ促進税制」の適用漏れが見つかりました。
即座に還付申請を行った結果、約80万円が還付され、変更後の年間顧問料を賄える程の結果となりました。
専門性の高い税理士の目を導入することの費用対効果を早くも実感する出来事となりました。

■ クラウド化とチャットツール活用で、事務負担とストレスを軽減!
年1回の紙のやり取りから、クラウド上にデータをアップロードする経理フローに変更しました。
税理士からのこまめな提出指示とフィードバックにより、書類紛失のリスクや夜間の事務作業ストレスが激減しました。

また、チャットツールを活用することで、ベースアップの相談や日々の疑問に対してスピーディーかつ的確な回答が得られるようになりました。
経営者としての孤独感が解消され、心から信頼できるパートナーを得ることができました。
以前は電話でのやりとりもあったため、時間を気にする必要がありましたが、時間を気にせず遠方でも気軽にコミュニケーションが取れるようになりました。
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税理士セレクションの想い
~企業と税理士のミスマッチを解決したい~
弊社では全国約6,765の中小企業様及び約300の会計事務所様とのお付き合いをさせていただいておりますが、成長意欲の高い中小企業の皆さまとハイレベル会計事務所のミスマッチが発生していることを痛感しておりました。
弊社のお客様は成長志向の企業様が多く、経営者や経営幹部のレベルは高いのですが、税理士だけは年商2~3億規模の企業と変わらない…というケースが非常に多くございます。実際、弊社では税理士変更支援を公には告知していないにも関わらず、過去数々の税理士変更のご相談を頂戴しております。
船井総研会計業界専門コンサルタントが皆様の顧問税理士に関するお話しを伺い、税理士変更をすべきか否かのアドバイスをさせていただきます。また、税理士変更をご検討の際にはハイレベル会計事務所を選定しご紹介を行うことにより、皆さまの事業成長の後押しをしてくれる真のパートナー探しの一助になれればと考えております。